Все время забываю как это делается, поэтому напишу здесь. Надо перейти во вкладку Tools, открыть панель Print production, дальше открыть окно Preflight. Там выбираем свиток PDF fixups и прогоняем скрипт Convert fonts to outlines. Готово.

Инструкция для Adobe Acrobat DC.